来源:广东教育头条 时间:2023-08-14
近日,仲恺农业工程学院联合华大海洋,成功破译匀斑裸胸鳝的全基因组序列,构建并发表首个鳗鲡目海鳝科鱼类的高质量染色体图谱,揭示了裸胸鳝特有的基因重复片段扩张现象,探讨鳗形目鱼类的染色体重排和进化机制。该成果发表于Nature子刊Scientific Data。
仲恺农业工程学院副教授张凯、硕士研究生张煜轩、副教授梁日深,华大海洋研究院助理院长黄玉为该论文的共同第一作者,仲恺农业工程学院动物科技学院院长林蠡、华大海洋研究院院长石琼为该论文的共同通讯作者。
匀斑裸胸鳝的表型特征观察,没有胸鳍、腹鳍和鳞片。张煜轩 摄
什么是匀斑裸胸鳝?
“匀斑裸胸鳝是海水鳗的重要代表物种,隶属于鳗鲡目、海鳝科、裸胸鳝属,长相奇特,尤其是皮肤光滑且具特色花纹、缺乏胸鳍腹鳍以及鳞片。”张凯说,这些特征使得裸胸鳝在表型上与其他鱼类有所区别,也影响了其生活方式和行为模式。
“鳗鲡目在生态学和生物进化研究中具有重要地位,但目前对其基因组的了解十分有限,海水鳗的基因组数据尤为缺乏。”张凯介绍,此次研究是首次对鳗鲡目中海鳝科的基因组进行详细解读,重点围绕海水鳗和淡水鳗的基因组特性分析,比较两类鱼在基因组大小、重复片段含量和组成成分、染色体数目及排列等方面的差异,使得深入探究海水鳗生物学和遗传学特性成为可能,弥补了海水鳗数据缺乏的不足,将为裸胸鳝的人工繁育和规模化养殖提供指导性支撑。
裸胸鳝基因组调查(a)及染色体图谱绘制(b-c)。
“当前,我们正在开展更多水产动物基因组的解析工作,将发挥高校自身和合作企业的特色优势,进一步深化基因组学支撑的分子育种与产业合作,为广东现代渔业的高质量发展贡献力量。”张凯说。